La structure de la Direction de la santé est composée d'un département médical et technique et d'un département administratif. Le département médical et technique comportent 9 divisions et 11 services, se rapportant à l’organigramme ci-dessous.
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- Directeur de la Santé
Dr Jean-Claude Schmit
- Directeur adjoint médical et technique
Dr Françoise Berthet
- Service audiophonologique
- Service d'orthoptie
- Service coordination plans nationaux
- Division de l'inspection sanitaire
- Division de la médecine préventive
- Division de la médicine scolaire et de la santé des enfants adolescents
- Division de la médicine curative et de la qualité en santé
- Division de la pharmacie et des médicaments
- Division de la radioprotection
- Division de la santé au travail et de l'environnement
- Division de la médecine sociale, des maladies de la dépendence et de la santé mentale
- Division de la sécurité alimentaire
- Directeur adjoint administrative
M. Xavier Poos
- Secrétariat de direction
- Service budget et finances
- Service GRH, bâtiments et logistique
- Service Informatique et bases de données
- Secrétariat de direction
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- Directeur adjoint médical et technique
- Directeur de la Santé